[業界新聞] NVIDIA BioNeMo 在AWS 上實現用於藥物發現的生成式人工智慧 - XFastest
藥物預測目標配方新聞人工智慧XFastest生成式NVIDIA最佳化BioNeMo載入器 文章 參考資訊
領先的製藥和科技生物公司的研究人員和開發人員現在可以透過 Amazon Web Services(AWS)輕鬆部署 NVIDIA Clara 軟體和服務[1],用於加速醫療保健。
這項計畫今日在AWS re:Invent上宣佈,它讓使用AWS 雲端資源的醫療保健和生命科學開發人員能夠靈活地整合NVIDIA 加速的產品,例如用於藥物發現的生成式人工智慧平台NVIDIA BioNeMo[2]。這個平台將整合到AWS 上的NVIDIA DGX Cloud[3],並已可透過實現高效能運算的AWS ParallelCluster 叢集管理工具和機器學習服務的Amazon SageMaker使用。
全球有數千家醫療保健和生命科學公司使用 AWS。 他們現在將能夠存取 BioNeMo,利用專有資料建置或客製化數位生物基礎模型,並使用 AWS 上的 NVIDIA GPU 加速雲端伺服器擴大模型訓練和部署規模。
包括Alchemab Therapeutics[4]、Basecamp Research[5]、Character Biosciences[6]、Evozyne[7]、Etcembly[8]和LabGenius[9]在內的科技生物創新者已經是AWS的用戶,他們正在使用BioNeMo進行生成式人工智慧加速的藥物發現和開發。此次合作為他們提供了更多方法來快速擴展雲端運算資源,以開發基於生物分子資料訓練的生成人工智慧模型。
此次發布擴展了NVIDIA在AWS上現有的醫療保健用產品,像是用於醫學影像工作流程的NVIDIA MONAI[10]和用於加速基因組學的NVIDIA Parabricks[11]。
AWS新增加項目:NVIDIA BioNeMo推進用於藥物發現的生成式人工智慧
BioNeMo[12] 是數位生物生成人工智慧的特定領域框架,包括預先訓練的大型語言模型、資料載入器和最佳化的訓練配方,可透過加速目標識別、蛋白質結構預測和候選藥物篩選來幫助推進電腦輔助藥物發現。
藥物探索團隊可以使用其專有資料透過 BioNeMo 建立或最佳化模型,並在基於雲端的高效能運算叢集上運行模型。
其中一個模型 ESM-2(一種支援蛋白質結構預測的強大的大型語言模型)在 256 個 NVIDIA H100 Tensor Core GPU 上實現了幾乎線性的伸縮。 研究人員可以擴展到 512 個 H100 GPU並在幾天內完成訓練,而不是原始論文中公佈所需的一個月訓練時間。
開發人員可以使用 6.5 億或 30 億個參數的檢查點大規模訓練 ESM-2。 BioNeMo 訓練框架支援的其他人工智慧模型包括小分子生成式模型 MegaMolBART 和蛋白質序列生成式模型 ProtT5。
BioNeMo 的預訓練模型和最佳化訓練方案能幫助研發團隊建立基礎模型,以探索更多候選藥物、最佳化濕實驗室實驗並更快地找到有前途的臨床候選藥物,可使用 AWS ParallelCluster 和 Amazon ECS 等自我管理服務以及透過 NVIDIA DGX Cloud 和 Amazon SageMaker 的整合託管服務取得。
AWS 上也提供:NVIDIA Clara用於醫學影像和基因組學
MONAI 計畫由 NVIDIA 共同創立並由企業支持[13],旨在支援醫學影像工作流程,已經被下載超過 180 萬次,並且可在 AWS 上部署。 開發人員可以利用已儲存在 AWS 雲端資源上的專有醫療保健資料集來快速註釋和建立用於醫學成像的人工智慧模型。
這些模型在 NVIDIA GPU 驅動的 Amazon EC2 執行個體[14]上進行訓練,可用於醫學影像中分割、分類、註冊和偵測任務的互動式註解和微調。 開發人員還可以利用 MONAI 中提供的核磁共振影像合成模型來增強訓練資料集。
為了加速基因組學流程,Parabricks[15]可以在大約 15 分鐘內對整個人類基因組進行變體識別,而僅使用CPU 系統則需要一天的時間。 在 AWS 上[16],開發人員可以快速擴展以跨多個 GPU 節點處理大量基因組資料。
Amazon HealthOmics 上提供了十多個 Parabricks 工作流程[17]作為 Ready2Run 工作流程,使客戶能夠輕鬆運行預先建置的管道。
開始使用 AWS 上的 NVIDIA Clara 來加速藥物發現、基因組學和醫學成像的人工智慧工作流程。
[18]
References
NVIDIA Clara 軟體和服務 (aws.amazon.com) NVIDIA BioNeMo (www.nvidia.com) NVIDIA DGX Cloud (www.nvidia.com) Alchemab Therapeutics (www.alchemab.com) Basecamp Research (www.basecamp-research.com) Character Biosciences (www.characterbio.com) Evozyne (www.evozyne.com) Etcembly (www.etcembly.com) LabGenius (labgeni.us) NVIDIA MONAI (www.nvidia.com) NVIDIA Parabricks (www.nvidia.com) BioNeMo (www.nvidia.com) NVIDIA 共同創立並由企業支持 (www.nvidia.com) Amazon EC2 執行個體 (aws.amazon.com) Parabricks (aws.amazon.com) 在 AWS 上 (aws.amazon.com) Amazon HealthOmics 上提供了十多個 Parabricks 工作流程 (aws.amazon.com) AWS 上的 NVIDIA Clara (aws.amazon.com)[no_relate_sql.name;block=a]
健保總額成長率達上限!健保署:明年健保費率仍不影響|生活-Newtalk新聞
健保署回應,因應COVID-19相關醫療費用自112年3月20日回歸健保支應,並加上疫後就醫人潮回流,爭取預算補貼疫後點值。且113...
用吃的防十大癌症之冠-肺癌!營養師推6營養,大蒜、菠菜都上榜。|蕃新聞
據最新台灣十大癌症發生人數統計,肺癌已超越大腸癌位居首位,護肺刻不容緩。簡鈺樺營養師分享如何靠「吃的」保養肺部,護肺...
花蓮縣光復鄉光復國小舉行捐贈儀式「光復國小牙科治療椅捐贈儀式」-台灣新聞雲
健康保險署健保署東區業務組邊子強參議代表與會,表現對偏鄉牙科醫療的重視。菁華牙醫診所院長張家納醫師於光復鄉設診服務超...
【漂流過境】五旬漢深圳玩直立板墮海漂浮回港學者籲勿單獨出海-無綫新聞TVBNews
發佈日期:2024-02-2518:30港澳粵普已複製連結一名59歲男子在深圳鹽田玩水上直立板期間墮海。深港兩地警方搜索了大半天都沒有...
水果「當正餐、空腹吃」!他吃出脂肪肝、糖尿病長期發炎恐肝癌-NOWnews今日新聞
控制體重,避免肥胖規律飲食,宜少油、少鹽、少糖多攝取膳食纖維,但不宜過量,尤其水果不能當正餐吃培養運動習慣脂肪肝幾乎...
【醫生怎麼辦】中醫師依體質將減肥分類為五型肥胖!先搞懂再減肥更有效
【醫生怎麼辦】先搞懂體質再減肥!中醫師將肥胖分成5類讓減肥更有效(示意圖/Gettyimage)看著體重機上的數字一直攀升,想減肥...
罕病律師陳俊翰40歲驟逝!健保最貴藥物1劑4900萬就用在此病-康健
罹患罕見疾病脊髓性肌肉萎縮症的律師陳俊翰,春節期間因感冒引發併發症病逝,得年40。兩年前陳俊翰放棄美國對罕病病患周全的...
高中妹「胸部硬硬」拖2年!穿刺驚是惡性醫籲「自摸」救命
女高中生在16歲時摸出胸部有腫塊。(示意圖,非當事人/shutterstock達志影像)根據衛福部統計,每年有逾萬位婦女罹患乳癌,...
攻NGS高階檢測市場!基米擴大LDTs認證項目申請
台寶生醫登美移植醫學年會;浩鼎4論文登2024AACR;樂迦再生醫療長張裕享接任執行長;巨生醫完成1.5億現增;豪森6.9億美元攜...